饮用水的病原微生物感染，是目前大的危害人们健康的问题之一。尤其是在一些贫穷落后地区，介水传染病依然是危害人健康的重要疾病，解决饮用水中的微生物污染，尤为重要。世界卫生组织在其《饮用水水质准则》中指出：

“微生物污染的潜在后果使对其控制总是重要的，绝不允许让步”。

一般情况下未受污染的水体不含有致病的微生物，而当水体受到污染时，各种病原体，随含有人畜排泄物及其它污染物的污水进入水体，终导致介水传染病的传播和流行。

在正常情况下，肠道中主要有大肠杆菌、粪链球菌和厌氧芽孢杆菌等多种细菌。这些细菌都可以随人畜排泄物进入水源，由于大肠菌群在肠道内数量多，所以，水源中大肠菌群的数量，是直接反映水源被人畜排泄物污染的一项重要指标。因而对饮用水必须进行大肠杆菌污染的检查。

水中大肠杆菌的检测方法，常用多管发酵法和滤膜法。多管发酵法可适用于各种水样的检验，但操作繁琐，需要的时间较长。滤膜法仅适用于自来水和深井水，操作简单、快速，但不适用于杂质较多的水样。